Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COMMD8Q9NX08 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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