Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO28Q9NVF7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FBXO28Q9NVF7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FBXO28Q9NVF7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms