Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TDP1Q9NUW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TDP1Q9NUW8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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