Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTLC3Q9NUV7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPTLC3Q9NUV7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms