Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ABCF3Q9NUQ8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ABCF3Q9NUQ8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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