Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMC4Q9NTJ3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMC4Q9NTJ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms