Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATG3Q9NT62 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATG3Q9NT62 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms