Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SNTG1Q9NSN8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms