Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TOPORSQ9NS56 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TOPORSQ9NS56 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms