Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX1Q9NRD9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DUOX1Q9NRD9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DUOX1Q9NRD9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms