Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CYLDQ9NQC7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CYLDQ9NQC7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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