Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KCNMB3Q9NPA1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KCNMB3Q9NPA1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms