Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C10orf88Q9H8K7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C10orf88Q9H8K7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms