Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCSER2Q9H7U1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCSER2Q9H7U1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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