Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDM12Q9H4Q4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM12Q9H4Q4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM12Q9H4Q4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms