Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KCNQ1DNQ9H478 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
KCNQ1DNQ9H478 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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