Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1D9

POLR3F, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3FQ9H1D9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
POLR3FQ9H1D9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
POLR3FQ9H1D9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms