Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDCBP2Q9H190 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms