Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SHARPINQ9H0F6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SHARPINQ9H0F6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms