Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
USP44Q9H0E7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
USP44Q9H0E7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms