Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF541Q9H0D2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF541Q9H0D2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms