Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
POLR1EQ9GZS1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms