Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SEMA4CQ9C0C4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms