Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTPBP4Q9BZE4 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTPBP4Q9BZE4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms