Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TBC1D2Q9BYX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TBC1D2Q9BYX2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms