Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NIFKQ9BYG3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIFKQ9BYG3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms