Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK3Q9BYB0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SHANK3Q9BYB0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms