Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
FANCD2Q9BXW9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
FANCD2Q9BXW9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
FANCD2Q9BXW9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms