Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDCA7Q9BWT1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDCA7Q9BWT1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms