Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBB2BQ9BVA1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBB2BQ9BVA1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms