Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NDC1Q9BTX1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms