Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAGR1Q9BTK6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAGR1Q9BTK6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms