Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
THUMPD2Q9BTF0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
THUMPD2Q9BTF0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms