Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HERPUD2Q9BSE4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERPUD2Q9BSE4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms