Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP3BQ9BS92 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NIPSNAP3BQ9BS92 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms