Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SEC22CQ9BRL7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SEC22CQ9BRL7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms