Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DDX50Q9BQ39 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DDX50Q9BQ39 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms