Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
APOL4Q9BPW4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
APOL4Q9BPW4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms