Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VGLL1Q99990 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VGLL1Q99990 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms