Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
AGPAT1Q99943 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGPAT1Q99943 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms