Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYD88Q99836 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MYD88Q99836 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MYD88Q99836 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms