Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POP1Q99575 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POP1Q99575 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POP1Q99575 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
POP1Q99575 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POP1Q99575 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POP1Q99575 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POP1Q99575 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms