Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
RPS6KC1Q96S38 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KC1Q96S38 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms