Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ALPK3Q96L96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALPK3Q96L96 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms