Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SUSD3Q96L08 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUSD3Q96L08 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms