Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJD4Q96KN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
GJD4Q96KN9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GJD4Q96KN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms