Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CABS1Q96KC9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CABS1Q96KC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CABS1Q96KC9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CABS1Q96KC9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CABS1Q96KC9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CABS1Q96KC9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms