Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PGBD1Q96JS3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PGBD1Q96JS3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms