Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EAF1Q96JC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EAF1Q96JC9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms