Protein–RNA interactions for Protein: Q96HW7

INTS4, Integrator complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS4Q96HW7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS4Q96HW7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS4Q96HW7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS4Q96HW7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
INTS4Q96HW7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INTS4Q96HW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INTS4Q96HW7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms